Archives de catégorie : Thèses / HDR

Soutenance de These de Delphine Vertu-Ciolino

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Félicitations à Delphine Vertu-Ciolino pour son titre de Docteur de l’Université de Lyon suite à sa soutenance de thèse, le 9 décembre dernier, portant sur la Reconstruction du cartilage nasal par impression 3D et ingénierie tissulaire.

Delphine a défendu ses travaux devant le jury composé de : Pr Jean-Christophe Farges, PU-PH Université Lyon 1, Président du jury; Dr Magali Demoor, MCU Université de Caen, Rapportrice; Dr Delphine Logeart-Avramoglou, DR CNRS Paris, Rapportrice; Dr Emeline Perrier-Groult, CR CNRS Montpellier, Examinatrice; Dr Frédéric Mallein-Gerin, DR CNRS Lyon, Directeur de thèse: Dr Jean-Daniel Malcor, CR CNRS Lyon, Co-directeur de thèse, Dr Christophe Marquette, DR CNRS Lyon, Invité

Ce travail a été menée sous la direction de Frédéric Mallein-Gerin et la codirection de Jean-Daniel Malcor, dans l’Equipe ROAD (Recherche OstéoArticulaire et Dentaire, Responsable d’Equipe : Frédéric Mallein-Gerin), du Laboratoire de Biologie Tissulaire et Ingénierie thérapeutique (LBTI), UMR 5305 CNRS-Université Lyon 1, Lyon.

Dans le contexte de la chirurgie reconstructive du nez, le projet de Delphine a permis de developper un concept de prothèse de cloison nasale combinant un support structurel fait d’un matériau de qualité médicale, avec une structure poreuse, imprimable en 3D, recouverte d’un hydrogel de fibrine chargé de chondrocytes nasaux humains. Cette étude a permis de développer une prothèse de cartilage nasal hautement biocompatible, pour répondre aux défis mécaniques et améliorer l’immunotolérance du tissu reconstruit. Pour en savoir plus sur ce projet, vous pouvez consulter le document joint.Résumé thèse Delphine

Soutenance d’HDR de Johanne LEROY-DUDAL

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Johanne LEROY-DUDAL

Laboratoire ERRMECe EA 1391 (Gpe MEC-uP)
CY Cergy Paris Université.

La soutenance d’Habilitation à Diriger des Recherches de Mme Johanne LEROY-DUDAL intitulée « Interactions cellules – microenvironnement : de la physiopathologie à « l’ingénierie » des matrices extracellulaires« , s’est tenue en hybride le mardi 22.02.2022, à l’auditorium de la Maison Internationale de la Recherche, site de Neuville devant le jury suivant :

  • Mme Nathalie THERET (Rapporteure) – Directrice de Recherche INSERM – Université de Rennes I
  • Mme Magali DEMOOR (Rapporteure) – Maître de Conférences HDR- Université Caen Normandie
  • M. Ulrich VALCOURT (Rapporteur) – Professeur des Universités – Université de Lyon I, Président du Jury.
  • Mme Laure GIBOT (Examinatrice) – Chargée de Recherche CNRS – Université de Toulouse III
  • M. Hugues BERRY (Examinateur) – Directeur de Recherche INRIA – Lyon I
  • M. Olivier GALLET (Garant  HDR) – Professeur des Universités – CY Cergy Paris Université

Soutenance de thèse de Sara Gouardères

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Sara Gouardères – IMRCP CNRS UMR5623, Université Paul Sabatier Toulouse III

Soutiendra le 17 décembre 2021 sa thèse de doctorat, spécialité Chimie-Biologie-Santé, intitulée :

Réponses cellulaires et tissulaires de la peau humaine à l’application d’un champ électrique externe de type électroporation

Son travail de thèse a été dirigé par :
Laure Gibot (PhD, HDR, CR CNRS, IMRCP, Laboratoire des Interactions Moléculaires et Réactivité Chimique et Photochimique)

Résumé
Les cellules cutanées sont naturellement électrosensibles, en raison de l’existence d’un potentiel électrique transépithélial endogène. L’application d’un champ électrique exogène pulsé (i.e électroporation) est utilisée en clinique humaine et vétérinaire pour le traitement local des cancers cutanés (électrochimiothérapie, ECT) et pour le transfert de gène (électrotransfert de gène, GET). L’hypothèse de ce projet de thèse est donc que le champ électrique seul, appliqué en ECT et en GET, peut affecter le comportement des cellules cutanées, moduler le remodelage de la matrice extracellulaire par les fibroblastes, promouvoir l’angiogenèse, et stimuler la migration et de la différenciation des kératinocytes. Ainsi, les objectifs de ce travail étaient de comprendre, visualiser et quantifier les réponses des cellules cutanées à la suite de l’application d’un champ électrique externe de type électroporation. Les études réalisées sur des cultures en 2D indiquent que l’électroporation directe des fibroblastes dermiques ne modifie ni leur prolifération ni leur migration. D’autre part, bien que les paramètres électriques appliqués assurent 100% d’électroperméabilisation réversible, une apoptose légère apparaît dans environ 30% de la population soumise aux champs électriques à l’intensité la plus élevée. Cette apoptose semble être la conséquence de la génération de stress mitochondrial. Fait intéressant, le sécrétome des cellules apoptotiques améliore significativement la migration de fibroblastes non exposés, vraisemblablement via une sécrétion accrue de facteurs de croissance des cellules exposées. Ensuite, un modèle de substitut dermique humain reconstruit par ingénierie tissulaire a été utilisé pour réaliser une analyse multi-échelle des processus électro-induits au niveau tissulaire. Nous avons démontré que le feuillet dermique est un modèle polarisé très riche en matrice extracellulaire endogène et que le haut degré de complexité de celle-ci en fait un modèle de choix pour l’étude du remodelage matriciel. Nos résultats montrent que les champs électriques de type électroporation induisent une modulation rapide des gènes associés au matrisome (c’est-à-dire les gènes codants des protéines de la matrice extracellulaire ou des protéines qui y sont associées), en particulier une régulation à la baisse des enzymes de maturation telles que la transglutaminase TG2 et la lysyl-oxydase like LOXL4. De plus, une diminution transitoire de la production du pro-collagène de type 1a1 et de la teneur en hydroxyproline dans le tissu a lieu dans la semaine suivant l’électroporation. Ce remodelage du collagène est principalement dépendant des MMPs en raison de leur suractivation ROS-dépendante. De plus, nos données démontrent que les champs de type électroporation régulent à la baisse le TGF-β (ARNm et protéine), un acteur clé de la fibrose pathologique. En outre, les fibroblastes dermiques électroporés sécrètent massivement des facteurs de croissances pro-angiogéniques tels que le FGFb, le VEGFA et le PDGFA. Le sécrétome de fibroblastes dermiques électroporés favorise ainsi la migration en 2D des cellules endothéliales non électroporés ainsi que la formation de réseaux vasculaires en 3D. En conclusion, ces travaux mettent en lumière la pertinence de l’utilisation de champs électriques pulsés comme stratégie de remodelage de l’environnement matriciel et vasculaire. Ces recherches présentent un fort potentiel translationnel car l’électroporation est déjà utilisée en clinique et des appareils validés sont disponibles, ce qui ouvre de nombreuses perspectives pour d’autres applications cliniques de cette technologie.

Contact pour obtenir le lien zoom: gibot@chimie.ups-tlse.fr

Soutenance de thèse de Fida AZAR

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Fida AZAR – Université de Rennes 1, INSERM UMR1085-IRSET

Soutiendra le 7 Janvier 2021 sa thèse de doctorat, spécialité « Cancérologie », intitulée :

Rôle de la Protéine ADAMTS12 dans la progression des maladies Hépatiques Chroniques

Son travail de thèse a été dirigé par :
le Dr. Nathalie THERET (DR INSERM, Université de Rennes 1, Rennes)
et le Professeur Mona DIAB-ASSAF (Université Libanaise, Liban).

 

Soutenance d’HDR de Caroline REYNAUD

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Caroline REYNAUD

Laboratoire LYOS INSERM UMR 1033 – Equipe 2 Bone, Cancers and Metastases – Université de Lyon

Rôle des Lysyl Oxydases dans la progression tumorale

Le Docteur Caroline REYNAUD a soutenu son Habilitation à Diriger des Recherches le 19 novembre 2019 devant un jury composé de :

  • Pr Ulrich VALCOURT, président
  • Dr Catherine MONNOT, rapporteur
  • Pr Maxime LEHMANN, rapporteur
  • Pr Laurent DUCA, rapporteur
  • Dr Philippe CLEZARDIN, examinateur

Soutenance de thèse – Cathy Pichol-Thievend

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Cathy Pichol-Thievend

Centre de Recherche Interdisciplinaire en Biologie (CIRB)- CNRS UMR 7241 / Inserm U1050 -Collège de France, Paris.
Equipe: Hypoxie angiogenese et intégrité vasculaire en pathologie cardiovasculaire et tumorale.

Titre : Rôle de la Lysyl oxidase-like-2 dans l’assemblage de la matrice extracellulaire et l’angiogenèse.

Date de soutenance : mercredi 3 octobre 2012

Directeur Equipe : Stéphane Germain
Directrice de thèse : Catherine Monnot
Encadrant scientifique de thèse : Laurent Muller

Mots-clefs : Hypoxie, angiogenèse, matrice extracellulaire, Lysyl oxidase-like-2

Résumé :

L’angiogenèse joue un rôle déterminant lors du développement et dans les pathologies ischémiques vasculaires et tumorales. Au cours de ces processus, la matrice extracellulaire est profondément remodelée. Les mécanismes moléculaires impliqués dans l’assemblage de la matrice extracellulaire et leur rôle dans la formation de capillaires sont encore peu connus.

Par une analyse protéomique différentielle, l’équipe a identifié LOXL2 comme étant une cible majeure de l’hypoxie dans la matrice extracellulaire des cellules endothéliales. LOXL2 est exprimée dans les capillaires au cours du développement et dans un modèle d’ischémie critique du membre inférieur. Par des expériences de perte d’expression chez l’embryon de poisson-zèbre, nous avons pu mettre en évidence que LOXL2 est impliquée dans la formation des vaisseaux intersegmentaux. Dans un modèle in vitro de formation de tubes endothéliaux en 3D, nous avons démontré que LOXL2 régule la tubulogenèse. Nous avons également démontré que la perte d’expression de LOXL2 entraine une diminution importante de l’assemblage du collagène de type IV dans la matrice extracellulaire des cellules endothéliales (HUVEC) in vitro. De plus, la perte d’expression de la chaine α1 du collagène de type IV dans les HUVEC inhibe la tubulogenèse de façon similaire à la perte d’expression de LOXL2, suggérant ainsi que l’interaction de LOXL2 avec le collagène de type IV est à même de transmettre les effets décrits. Alors que la perte d’expression de LOXL2 altère fortement l’angiogenèse et l’assemblage du collagène de type IV les effets de l’inhibition pharmacologique de son activité lysyl oxydase sont très limités. Par une approche structure-fonction nous avons pu montré que l’activité catalytique de LOXL2 n’est impliquée ni dans la formation de capillaires ni dans l’assemblage du collagène de type IV.

L’ensemble de ce travail a permis de démontrer que LOXL2 régule l’angiogenèse. L’induction de l’expression de LOXL2 par des facteurs pro-angiogéniques dont l’hypoxie, initie l’assemblage du collagène de type IV dans la lame basale par les cellules endothéliales constituant ainsi un microenvironnement optimal pour la prolifération et la migration des cellules endothéliales ainsi que pour la formation d’un vaisseau fonctionnel.

Soutenance de these – Benoit Langlois

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Benoit LANGLOIS

Laboratoire SiRMa – signalisation et récepteurs matriciels
CNRS UMR 6237 MEDyC – matrice extracellulaire et signalisation cellulaire
UFR Sciences Exactes et Naturelles de Reims

Titre : Etude de la signalisation cellulaire et des interactions biomoléculaires induites par LRP-1 dans le cadre de l’invasion tumorale.
Date de soutenance : 16 septembre 2010
Directeur de thèse : Laurent MARTINY/Myriam POLETTE

Résumé :

LRP-1 (low-density lipoprotein receptor-related protein-1) est un récepteur d’endocytose multifonctionnel internalisant divers ligands extracellulaires, incluant certaines protéases matricielles impliquées dans la dissémination des cancers. Initialement perçu comme un suppresseur de tumeur potentiel, des travaux récents ont suggéré que LRP-1 pourrait faciliter la formation de métastases et son rôle dans la progression tumorale demeure controversé. Afin de préciser l’impact de LRP-1 sur le potentiel invasif de cellules cancéreuses, nous avons mis en place une stratégie d‚invalidation de son expression par shRNA. Nous montrons que la répression de LRP-1 ralentit l’invasion en dépit d‚une accumulation péricellulaire de la MMP-2 et de l’uPA. Les cellules déficientes pour LRP-1 présentent de profonds bouleversements dans l’organisation du cytosquelette et une morphologie atypique caractérisée par une absence de projections membranaires. De plus, la répression de LRP-1 accélère l’adhérence à la matrice et entraîne une accumulation de contacts focaux en périphérie cellulaire. En contrôlant l’activation de la voie ERK et l’inhibition de la voie JNK ainsi que l‚adressage des MAPK au sein des complexes focaux, LRP-1 orchestre l’organisation du cytosquelette d’actine et soutient la dynamique des interactions cellule-matrice, contribuant ainsi au maintien d’un état d’attachement favorable à l’invasion. L’ensemble de ces résultats apporte de nouveaux éléments dans la compréhension de la contribution de LRP-1 au comportement agressif des cancers et ouvre des perspectives innovantes dans le blocage ciblé du récepteur en thérapie anti-tumorale.

Mots-clefs : LRP-1/protéases matricielles/invasion tumorale/contacts focaux/ERK/JNK.

Soutenance de these – Emilie Chautard

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Emilie CHAUTARD
Institut de Biologie et Chimie des Protéines, UMR 5086 CNRS – Université Lyon 1, Lyon

Titre : Construction et analyse de réseaux d’interactions extracellulaires
Directeur de thèse : S. Ricard-Blum
Date de soutenance : 21 septembre 2010
Membres du jury : Christine Brun (Marseille), Gilbert Deléage (Lyon), Nathalie Théret (Rennes), Nicolas Thierry-Mieg (Grenoble), S. Ricard-Blum (Lyon).

Résumé :

La matrice extracellulaire est constituée d’un réseau tridimensionnel de protéines et de polysaccharides complexes, les glycosaminoglycanes. Elle apporte un support structural aux tissus et aux cellules dont elle est capable de moduler la prolifération, la migration et la différenciation. Nous avons créé une base de données d’interactions extracellulaires protéine-protéine et protéine-glycosaminoglycanes, MatrixDB, qui est disponible sur le Web (http://matrixdb.ibcp.fr). Nous avons intégré des bases de données expérimentales, des données issues de l’analyse de la littérature et des données issues de bases de données publiquement disponibles. Nous avons respecté les standards de curation et d’échange du consortium IMEx dont fait partie MatrixDB. MatrixDB permet la construction et la visualisation de l’interactome extracellulaire entier et de plusieurs types de réseaux d’intéractions, spécifiques d’une molécule, d’un tissu, d’une pathologie ou d’un processus biologique. Nous avons ainsi caractérisé le réseau d’interactions extracellulaire associé au vieillissement et mis en évidence le rôle important des glycosaminoglycanes et du calcium dans ce réseau. Nous avons construit le réseau d’interactions d’une matricryptine anti-angiogénique et anti-tumorale, l’endostatine, qui est issue du collagène XVIII. Les analyses structurales et fonctionnelles de ce réseau ont montré que les partenaires de l’endostatine sont majoritairement impliqués dans l’adhésion cellulaire et que les domaines EGF (Epidermal Growth Factor) sont surreprésentés. Cette propriété nous a permis d’identifier expérimentalement d’autres partenaires de l’endostatine possédant un ou plusieurs domaines EGF et de nouvelles fonctions de l’endostatine. Nous avons modélisé les complexes formés par l’endostatine avec deux de ses partenaires pour identifier les sites d’interactions. Ces prédictions, associées aux données expérimentales, ont permis de déterminer des interactions susceptibles d’être établies simultanément par l’endostatine. L’intégration de ces données et les paramètres cinétiques et d’affinité dans le réseau d’interactions de l’endostatine sera utilisée pour proposer un modèle de son mécanisme d’action qui reste mal connu.

Mots-clefs : Angiogenese – Bases de données – Endostatine – Intégrines – Réseaux d’interactions – Interactomes – Matrice extracellulaire – Vieillissement.